山东省基督教两会指的是：山东省基督教三自爱国运动委员会和山东省基督教协会。

中华人民共和国成立之初，山东基督教界响应全国基督教三自爱国运动，彻底摆脱了外国势力的控制，走上了独立自主自办教会的道路。40年来，三自爱国运动改变了山东基督教的“洋教”形象，消除了过去外国差会所造成的教派林立、互相攻讦的局面，实行了联合礼拜，普遍建立了爱国组织，积极与社会主义社会相适应。爱国爱教，坚持自治、自养、自传，成为山东基督教的发展主流。

山东省基督教三自爱国运动委员会是山东省基督教的全省性爱国群众团体。1958年成立，会址设于济南。　　宗旨是：带领全省信徒爱国爱教，遵守宪法、法律、法规和国家政策，遵守社会道德风尚，坚持教会的独立自主，增强教内外团结，为办好山东教会提供服务，推动教会与时俱进。

山东省基督教三自的最高机构是山东省基督教代表会议。在该会议中选举产生委员会，并由全体委员选举产生委员会主席、副主席、秘书长、常务委员。每届任期五年。 

山东省基督教协会于1981年3月成立，是山东省基督教全省性教务机构。山东省基督教第三次代表会议期间，选举产生了山东省基督教协会第一届委员会，讨论并通过山东省基督教协会章程。

宗旨是：团结和带领全省所有信奉上帝、承认耶稣基督为主的基督徒爱国爱教，遵守宪法、法律、法规和国家政策，遵守社会道德风尚，在圣灵的引领下，同心合意，遵照圣经真理，三自爱国原则、教会规章，办好山东教会，推进教会与时俱进。

山东省基督教协会的最高机构是山东省基督教代表会议。在该会议中选举产生委员会，并由全体委员选举产生协会会长、副会长、总干事、常务委员，每届任期五年。（当时会址设在济南市经二路67号）

现任领导班子成员：

山东省基督教三自爱国运动委员会主席：高明

副主席：吴建寅、任现民、李洪玉、陈光旭、田立柱、赵克玉、黄斌、董美琴

秘书长：高 明（兼）

山东省基督教协会会长：高明

副会长：吴建寅、任现民、李洪玉、孙法田、张建顺、夏伶珺

总干事：涂智进

山东省基督教两会的会址目前设于济南市槐荫区粟山路356号（邮编250118）。